Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms