Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRT84Q9NSB2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms