Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SDHAF3Q9NRP4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms