Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFDN4Q9NQP4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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