Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSU72Q9NP77 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSU72Q9NP77 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms