Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PDE7BQ9NP56 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms