Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
BHLHE41Q9C0J9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms