Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms