Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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