Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIFKQ9BYG3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIFKQ9BYG3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms