Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPL3Q9BY60 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms