Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RSPO3Q9BXY4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms