Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNG6Q9BXT2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG6Q9BXT2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG6Q9BXT2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG6Q9BXT2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG6Q9BXT2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNG6Q9BXT2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms