Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms