Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERPUD2Q9BSE4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms