Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBA1CQ9BQE3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms