Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms