Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CDRT15Q96T59 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDRT15Q96T59 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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