Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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