Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SGF29Q96ES7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SGF29Q96ES7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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