Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM4SF19Q96DZ7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms