Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAF2Q96CS3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms