Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYTL4Q96C24 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYTL4Q96C24 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms