Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FAM3DQ96BQ1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FAM3DQ96BQ1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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FAM3DQ96BQ1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FAM3DQ96BQ1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FAM3DQ96BQ1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FAM3DQ96BQ1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FAM3DQ96BQ1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FAM3DQ96BQ1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
FAM3DQ96BQ1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FAM3DQ96BQ1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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