Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RGMAQ96B86 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms