Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSRNP3Q8WYN3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSRNP3Q8WYN3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSRNP3Q8WYN3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSRNP3Q8WYN3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSRNP3Q8WYN3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSRNP3Q8WYN3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms