Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LRRC17Q8N6Y2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms