Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C9orf40Q8IXQ3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf40Q8IXQ3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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