Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB43Q86YS6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB43Q86YS6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms