Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PBRM1Q86U86 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PBRM1Q86U86 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms