Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL8

Putative uncharacterized protein FLJ42384, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZVL8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Q6ZVL8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6ZVL8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms