Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC149Q6ZUS6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms