Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms