Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms