Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPP4R4Q6NUP7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms