Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1orf140Q5VVS0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1orf140Q5VVS0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms