Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB6CQ53S08 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms