Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf17Q53FE4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms