Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPAT3Q53EU6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms