Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GREB1Q4ZG55 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms