Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM71Q2Q1W2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM71Q2Q1W2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM71Q2Q1W2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM71Q2Q1W2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM71Q2Q1W2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM71Q2Q1W2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM71Q2Q1W2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM71Q2Q1W2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIM71Q2Q1W2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms