Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSMPQ1L6U9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MSMPQ1L6U9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms