Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF1AQ16665 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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