Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS72Q15906 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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