Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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