Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR1Q15399 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms