Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUM3Q15397 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUM3Q15397 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms