Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3GAP1Q15042 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3GAP1Q15042 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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