Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR1D2Q14995 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR1D2Q14995 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms