Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC10A1Q14973 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms